MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Frateuria aurantia DSM 6220 chromosome

Total Repeats: 70575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017033	CGT	2	6	28	33	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315352
2	NC_017033	GAA	2	6	67	72	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315352
3	NC_017033	GAT	2	6	106	111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315352
4	NC_017033	CAGC	2	8	198	205	25 %	0 %	25 %	50 %	383315352
5	NC_017033	AC	3	6	248	253	50 %	0 %	0 %	50 %	383315352
6	NC_017033	GCCG	2	8	272	279	0 %	0 %	50 %	50 %	383315352
7	NC_017033	GC	4	8	289	296	0 %	0 %	50 %	50 %	383315352
8	NC_017033	CGG	2	6	297	302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315352
9	NC_017033	CGA	2	6	309	314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315352
10	NC_017033	TCC	2	6	317	322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383315352
11	NC_017033	TGC	2	6	497	502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315352
12	NC_017033	GGC	2	6	508	513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315352
13	NC_017033	CGC	2	6	543	548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315352
14	NC_017033	TCG	2	6	611	616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315352
15	NC_017033	GAT	2	6	621	626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315352
16	NC_017033	GCT	2	6	687	692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315352
17	NC_017033	CGA	2	6	696	701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315352
18	NC_017033	TTC	2	6	709	714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383315352
19	NC_017033	ACC	2	6	727	732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383315352
20	NC_017033	GAA	2	6	736	741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315352
21	NC_017033	TTC	2	6	742	747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383315352
22	NC_017033	AGC	2	6	776	781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315352
23	NC_017033	CTGGG	2	10	850	859	0 %	20 %	60 %	20 %	383315352
24	NC_017033	GCC	2	6	901	906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315352
25	NC_017033	CGT	2	6	936	941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315352
26	NC_017033	CGA	2	6	948	953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315352
27	NC_017033	TGC	2	6	962	967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315352
28	NC_017033	CGTG	2	8	990	997	0 %	25 %	50 %	25 %	383315352
29	NC_017033	GCC	2	6	1024	1029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315352
30	NC_017033	CGGC	2	8	1044	1051	0 %	0 %	50 %	50 %	383315352
31	NC_017033	CTG	2	6	1090	1095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315352
32	NC_017033	AGA	2	6	1133	1138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315352
33	NC_017033	CCG	2	6	1142	1147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315352
34	NC_017033	ACT	2	6	1148	1153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383315352
35	NC_017033	GCG	2	6	1185	1190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315352
36	NC_017033	GCCT	2	8	1256	1263	0 %	25 %	25 %	50 %	383315352
37	NC_017033	GGCG	2	8	1282	1289	0 %	0 %	75 %	25 %	383315352
38	NC_017033	CAC	2	6	1296	1301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383315352
39	NC_017033	AGC	2	6	1370	1375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315352
40	NC_017033	GTC	2	6	1705	1710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315353
41	NC_017033	CTG	2	6	1753	1758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315353
42	NC_017033	GAT	2	6	1812	1817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315353
43	NC_017033	CGCA	2	8	1866	1873	25 %	0 %	25 %	50 %	383315353
44	NC_017033	CCAT	2	8	1913	1920	25 %	25 %	0 %	50 %	383315353
45	NC_017033	GCCA	2	8	1986	1993	25 %	0 %	25 %	50 %	383315353
46	NC_017033	AATCG	2	10	2007	2016	40 %	20 %	20 %	20 %	383315353
47	NC_017033	TGC	2	6	2054	2059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315353
48	NC_017033	ACGG	2	8	2073	2080	25 %	0 %	50 %	25 %	383315353
49	NC_017033	TTA	2	6	2109	2114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383315353
50	NC_017033	TGC	2	6	2126	2131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315353
51	NC_017033	CAG	3	9	2143	2151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315353
52	NC_017033	TCA	2	6	2234	2239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383315353
53	NC_017033	GGAA	2	8	2311	2318	50 %	0 %	50 %	0 %	383315353
54	NC_017033	GTC	2	6	2344	2349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315353
55	NC_017033	CAAG	2	8	2415	2422	50 %	0 %	25 %	25 %	383315353
56	NC_017033	G	6	6	2447	2452	0 %	0 %	100 %	0 %	383315353
57	NC_017033	GC	3	6	2460	2465	0 %	0 %	50 %	50 %	383315353
58	NC_017033	GTG	2	6	2492	2497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383315353
59	NC_017033	ATC	2	6	2530	2535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383315353
60	NC_017033	CTG	2	6	2626	2631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315353
61	NC_017033	TTGC	2	8	2694	2701	0 %	50 %	25 %	25 %	383315353
62	NC_017033	AGG	2	6	3774	3779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383315354
63	NC_017033	GCT	2	6	3886	3891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315354
64	NC_017033	GAG	2	6	3892	3897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383315354
65	NC_017033	CGT	2	6	3898	3903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315354
66	NC_017033	GGC	2	6	3956	3961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315354
67	NC_017033	AAC	2	6	3980	3985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315354
68	NC_017033	TGC	2	6	3995	4000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315354
69	NC_017033	ATG	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315354
70	NC_017033	CCG	2	6	4083	4088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315354
71	NC_017033	TGC	2	6	4119	4124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315354
72	NC_017033	GTG	2	6	4126	4131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383315354
73	NC_017033	TTG	2	6	4138	4143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383315354
74	NC_017033	AGC	2	6	4190	4195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315354
75	NC_017033	GTG	2	6	4237	4242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383315354
76	NC_017033	GATCT	2	10	4271	4280	20 %	40 %	20 %	20 %	383315354
77	NC_017033	TGG	2	6	4340	4345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383315354
78	NC_017033	CAA	2	6	4450	4455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315354
79	NC_017033	GCT	2	6	4467	4472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315354
80	NC_017033	TCC	2	6	4512	4517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383315354
81	NC_017033	CGG	2	6	4518	4523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315354
82	NC_017033	GTAT	2	8	4774	4781	25 %	50 %	25 %	0 %	383315355
83	NC_017033	CGA	2	6	4793	4798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315355
84	NC_017033	CAC	2	6	4812	4817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383315355
85	NC_017033	TGA	2	6	4847	4852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315355
86	NC_017033	TGGC	2	8	4858	4865	0 %	25 %	50 %	25 %	383315355
87	NC_017033	GTCAGC	2	12	4908	4919	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383315355
88	NC_017033	ATCC	2	8	4947	4954	25 %	25 %	0 %	50 %	383315355
89	NC_017033	GAA	2	6	4956	4961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315355
90	NC_017033	GTG	2	6	4980	4985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383315355
91	NC_017033	CGG	2	6	5003	5008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315355
92	NC_017033	CGT	2	6	5106	5111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315355
93	NC_017033	CAG	2	6	5127	5132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315355
94	NC_017033	ACG	2	6	5184	5189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315355
95	NC_017033	CCGT	2	8	5200	5207	0 %	25 %	25 %	50 %	383315355
96	NC_017033	CAT	2	6	5306	5311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383315355
97	NC_017033	CTTC	2	8	5371	5378	0 %	50 %	0 %	50 %	383315355
98	NC_017033	CGC	2	6	5404	5409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315355
99	NC_017033	CAA	2	6	5513	5518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315355
100	NC_017033	TTC	2	6	5699	5704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383315355
101	NC_017033	CTG	2	6	5784	5789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315355
102	NC_017033	GGC	2	6	5852	5857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315355
103	NC_017033	GC	3	6	5890	5895	0 %	0 %	50 %	50 %	383315355
104	NC_017033	TGC	2	6	6031	6036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315355
105	NC_017033	CCG	2	6	6094	6099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315355
106	NC_017033	GAC	2	6	6144	6149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315355
107	NC_017033	TGC	2	6	6229	6234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315355
108	NC_017033	CTT	2	6	6239	6244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383315355
109	NC_017033	GCC	2	6	6296	6301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315355
110	NC_017033	GCAA	2	8	6322	6329	50 %	0 %	25 %	25 %	383315355
111	NC_017033	CAG	2	6	6465	6470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315355
112	NC_017033	TGG	2	6	6558	6563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383315355
113	NC_017033	GCTG	2	8	6586	6593	0 %	25 %	50 %	25 %	383315355
114	NC_017033	GGC	2	6	6614	6619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315355
115	NC_017033	CGGC	2	8	6657	6664	0 %	0 %	50 %	50 %	383315355
116	NC_017033	GCT	2	6	6731	6736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315355
117	NC_017033	GAT	2	6	6813	6818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315355
118	NC_017033	GGTTCG	2	12	6834	6845	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	383315355
119	NC_017033	CG	3	6	6844	6849	0 %	0 %	50 %	50 %	383315355
120	NC_017033	AAAG	2	8	6896	6903	75 %	0 %	25 %	0 %	383315355
121	NC_017033	GCA	2	6	6907	6912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315355
122	NC_017033	AGC	2	6	6949	6954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315355
123	NC_017033	GCC	2	6	7020	7025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315355
124	NC_017033	GCA	2	6	7393	7398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315356
125	NC_017033	CGG	2	6	7417	7422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315356
126	NC_017033	CAG	2	6	7541	7546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315356
127	NC_017033	AGA	2	6	7558	7563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315356
128	NC_017033	GCC	2	6	7584	7589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315356
129	NC_017033	TGC	2	6	7621	7626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315356
130	NC_017033	CAG	2	6	7674	7679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315356
131	NC_017033	GGC	2	6	7719	7724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315356
132	NC_017033	CGG	2	6	7751	7756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315356
133	NC_017033	ATC	2	6	7819	7824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383315356
134	NC_017033	CCG	2	6	7882	7887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315356
135	NC_017033	AGGCC	2	10	7904	7913	20 %	0 %	40 %	40 %	383315356
136	NC_017033	CGC	2	6	7946	7951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315356
137	NC_017033	ACC	2	6	7974	7979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383315356
138	NC_017033	GCA	2	6	8060	8065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315356
139	NC_017033	GCC	2	6	8268	8273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315356
140	NC_017033	GAAG	2	8	8291	8298	50 %	0 %	50 %	0 %	383315356
141	NC_017033	CAT	2	6	8312	8317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383315356
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143	NC_017033	GCC	2	6	8328	8333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315356
144	NC_017033	GCC	2	6	8355	8360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315356
145	NC_017033	GAT	2	6	8370	8375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315356
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147	NC_017033	CTG	2	6	8457	8462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315356
148	NC_017033	GCG	2	6	8481	8486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315356
149	NC_017033	A	6	6	8487	8492	100 %	0 %	0 %	0 %	383315356
150	NC_017033	AAGGCC	2	12	8637	8648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315356
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152	NC_017033	ATG	2	6	8723	8728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315357
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154	NC_017033	TGCA	2	8	9002	9009	25 %	25 %	25 %	25 %	383315358
155	NC_017033	GCCGC	2	10	9037	9046	0 %	0 %	40 %	60 %	383315358
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159	NC_017033	CCG	3	9	9154	9162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315358
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161	NC_017033	GCC	3	9	9183	9191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315358
162	NC_017033	GCC	4	12	9195	9206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315358
163	NC_017033	GCC	2	6	9210	9215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315358
164	NC_017033	CCG	2	6	9217	9222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315358
165	NC_017033	CGC	2	6	9248	9253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315358
166	NC_017033	CCGC	2	8	9268	9275	0 %	0 %	25 %	75 %	383315358
167	NC_017033	GCC	2	6	9285	9290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315358
168	NC_017033	ACA	2	6	9323	9328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315358
169	NC_017033	CCG	2	6	9349	9354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315358
170	NC_017033	TGG	2	6	9401	9406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383315358
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172	NC_017033	CAG	2	6	9444	9449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315358
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212	NC_017033	CGA	2	6	11050	11055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315361
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222	NC_017033	CAGT	2	8	11386	11393	25 %	25 %	25 %	25 %	383315362
223	NC_017033	GGC	2	6	11399	11404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315362
224	NC_017033	CCT	2	6	11501	11506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383315362
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231	NC_017033	CCA	2	6	11853	11858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383315362
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234	NC_017033	TCC	2	6	12330	12335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383315363
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239	NC_017033	GCG	2	6	12506	12511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315363
240	NC_017033	CGA	2	6	12538	12543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315363
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242	NC_017033	ATCG	2	8	12581	12588	25 %	25 %	25 %	25 %	383315363
243	NC_017033	TGCC	2	8	12817	12824	0 %	25 %	25 %	50 %	383315364
244	NC_017033	ATGA	2	8	12876	12883	50 %	25 %	25 %	0 %	383315364
245	NC_017033	CCGG	2	8	12933	12940	0 %	0 %	50 %	50 %	383315364
246	NC_017033	AGC	2	6	12949	12954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315364
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248	NC_017033	CGTC	2	8	13146	13153	0 %	25 %	25 %	50 %	383315364
249	NC_017033	GCA	2	6	13282	13287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315364
250	NC_017033	TCG	2	6	13351	13356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315364
251	NC_017033	TGG	2	6	13396	13401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383315364
252	NC_017033	CTG	2	6	13416	13421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315364
253	NC_017033	GCTG	2	8	13427	13434	0 %	25 %	50 %	25 %	383315364
254	NC_017033	CG	4	8	13504	13511	0 %	0 %	50 %	50 %	383315364
255	NC_017033	CGG	2	6	13524	13529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315364
256	NC_017033	CAT	2	6	13589	13594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383315364
257	NC_017033	CAT	2	6	13625	13630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383315364
258	NC_017033	GGC	2	6	13637	13642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315364
259	NC_017033	TGGC	2	8	13716	13723	0 %	25 %	50 %	25 %	383315364
260	NC_017033	CAG	2	6	13767	13772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315364
261	NC_017033	CAGGGC	2	12	13818	13829	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	383315364
262	NC_017033	ACG	2	6	13847	13852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315364
263	NC_017033	GCG	2	6	13896	13901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315364
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386	NC_017033	CCAC	2	8	19501	19508	25 %	0 %	0 %	75 %	383315369
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